提取膠原蛋白廢水處理的難點主要體現在以下幾個方面：

一、廢水成分復雜

膠原蛋白提取過程中產生的廢水含有高濃度的有機物、無機鹽、蛋白質殘留及微生物污染物。這些成分使得廢水處理過程變得復雜且困難。

二、高COD/BOD值

廢水中含有大量未被完全利用或降解的有機物，導致化學需氧量（COD）和生物需氧量（BOD）值偏高。高COD/BOD值不僅增加了廢水處理的難度，還嚴重影響水體自凈能力。

三、高氨氮含量

蛋白質在降解過程中會產生大量氨氮，對水生生態系統構成威脅。同時，氨氮的存在也增加了廢水處理的難度和成本。

四、懸浮物與色度高

廢水中的蛋白質、脂肪等懸浮物以及某些色素物質使得廢水渾濁且顏色深重，這不僅影響廢水的感官質量，還增加了處理難度。懸浮物和色素的去除需要采用特定的物理或化學方法，增加了處理過程的復雜性。

五、微生物污染

提取過程中可能引入的微生物在廢水中繁殖，進一步加劇水質惡化。這些微生物的存在不僅影響廢水處理效果，還可能對處理設施造成損害。

六、處理工藝選擇困難

鑒于膠原蛋白廢水的復雜性，單一處理方法往往難以達到理想的處理效果。因此，需要采用物理法、化學法與生物法相結合的組合工藝。然而，組合工藝的選擇和優化需要考慮到廢水的具體成分、處理目標、經濟成本等多個因素，這使得處理工藝的選擇變得困難。

綜上所述，提取膠原蛋白廢水處理的難點主要體現在廢水成分復雜、高COD/BOD值、高氨氮含量、懸浮物與色度高、微生物污染以及處理工藝選擇困難等方面。為了解決這些難點，需要采用先進的廢水處理技術和管理方法，加強廢水處理過程的監測和控制，確保廢水處理效果達到相關標準和要求。