培菌步驟是指在污水處理系統中繁行和生長一些微生物，這些微生物以分解有機物的代謝作用為生。這些微生物會吸收污染物質并將其轉換為無害的物質。污水處理的培菌步驟是整個污水處理過程中最復雜和重要的部分

培菌過程中，需注意以下四點：

1、加快培養啟動過程：厭氧消化系統的處理主要對象是活性污泥，不存在毒性問題。但是厭氧消化菌繁殖速度太慢，為加快培養啟動過程，除投人接種污泥以外，還應做好厭氧消化污泥的加熱。

2、厭氧消化污泥培養，初期生污泥投加量與接種污泥的數量及培養時間有關，早期可按設計污泥量的30% ~50%投，到培養經歷了60天左右，可逐漸增加投泥量。若從監測結果發現消化不正常時，應減少投泥量。

3、厭氧消化系統處理城市污水處理廠的活性污泥，由于活性污泥中碳、氮、磷等營養是均衡的，能夠適應厭氧微生物生長繁殖的需要。因此，即使在厭氧消化污泥培養的初期也不需要和處理工業廢水那樣，加入營養物質。

4、城市污水廠厭氧消化系統，產生沼氣的時間較早，沼氣產量也較大。為防止發生爆炸事故，投泥前，應使用不活潑的氣體(氮氣)將輸氣管路系統中的空氣置換出去，以后再投泥；產生沼氣后，再漸把氮氣置換出去。